1977年毕业于武汉体育学院，1988年武汉体院武术理论与方法研究生毕业，同年6月获上海体育学院教育学硕士学位。
现为湖北大学体育学院体育教育训练学责任教授，硕士生导师，兼上海体育学院民族传统体育学外聘博士生导师，获中国武术八段称号。现为教育部全国体育教学指导委员会委员，教育部中小学教材审定委员会委员，中国武术协会委员，中国武术学会常委，湖北省武术协会副主席，湖北省高等学校体育教学指导委员会副主任,湖北省教育学会体育专业委员会理事长，享受湖北省政府特殊津贴。
主要从事武术理论与方法、学校体育心理方面的研究。曾先后主编出版全国高校体育教育专业本科与专科武术教材6部，出版专著与教学指导用书4部。主编与合著的著作有《中国武术教练员岗位培训教材》，《新编中学武术教材教法》、《初中体育教师培训教程》、《体育教育实习》、《实用防身绝招》、《少林棍棒技法》等；其中2000年出版的教育部规划教材《武术》，2002年获“全国普通高等学校优秀教材二等奖”。参加《中国武术百科全书》、《中国武术教练员岗位培训教材》、《中国武术教程》等多部武术专业书籍的编写工作。先后承担完成“中国武术段位制实施现状与对策研究”，“竞技武术奥运设项与对策研究”等国家和省级科研课题10余项。其中省教研课题“武术教学改革的实验研究”1997年获湖北省政府优秀教学成果奖。公开发表《优秀散打运动员心理特征的实验研究》《建立散打技术体系模式初探》以及武术教育方面的学术论文40余篇。其中《体育教育本科专业武术必修课程现状与对策研究》一文2004年获全国第七届大运会科报会一等奖。
目前正在主持普通高等教育“十五”国家级规划教材的编写，正在进行的有“关于武术教育改革和发展的研究”，“中国民族传统体育学人才培养现状与对策研究”，“中国传统武术与西方技击文化的比较研究”等国家和省级课题研究。除此之外，蔡仲林教授多次参与教育部组织的各级学校体育教育培养方案，指导纲要和教材的审定与改革研究工作。还多次参与中国武协组织的武术散打竞赛规则修订及技术调研工作，多次担任世界武术锦标赛、亚运会、世界杯武术散打比赛、亚洲武术锦标赛及全国武术锦标赛等赛事的裁判长、总裁判长及仲裁工作，曾荣获“全国十佳武术裁判员”称号。