湖南新宁人，1964年5月出生。
1979年考入中国科学技术大学少年班学习，获该校无线电电子学工学学士；
日本国立综合研究大学院大学（The Graduate University for Advanced Studies）生物系统科学博士。
1984 - 1999年任中国科学院武汉植物研究所研究实习员、助理研究员、副研究员(1992)、研究员(1996)、副所长(1997)；
1992-1998年曾在University of California-Berkeley和Michigan State University进行合作研究4年；
2002－2006年曾两次任日本文部科学省统计数理研究所外国人客员教授。
2000年起任复旦大学生命科学学院教授,植物学和生物信息学博士生导师；
现为复旦大学生命科学学院常务副院长，生物多样性与生态工程教育部重点实验室副主任，上海生物信息技术研究中心副主任；兼任北京大学理论生物学中心教授、西藏大学教授。