孔祥毅教授的主要研究领域：宏观金融理论和金融史。著作及获奖情况：《百年金融制度变迁与金融直辖市研究》、《宏观金融调控理论》、《金融理论教程》、《中央银行通论》、《金融贸易史论》、《金融经济纵论》等。曾获中国商业历史学会优秀成果一等奖，山西省人文社会科学一等奖，山西省人文社会科学一等奖。目前承担课题：“金融发展史”、“中国金融史”、“中国合作经济理论创新研究”等。