吴恒教授曾就读于南京大学地质系，师承我国工程地质专业知名教授罗国煜先生。从1982年1月～1984年12月，在罗先生的悉心指导下，他不仅在专业内容的深度与广度有长足的进展，而且获得终生受益的研究心得。这不仅有利于从事自然科学研究，对认识社会，剖析社会问题也大有裨益。他于1984年12月通过学位委员会的答辩，获得理学硕士学位。
　　
　　 1986年9月～1989年8月，他在中国科学院地质研究所攻读博士学位，师承我国著名的工程地质学家王思敬教授（王先生系国际工程地质学会主席，中国工程院院士）。在王先生指导下，他涉足环境领域，开始探索城市的起源，城市的地质环境依据，城市进一步发展的支撑环境等一系列面向人类未来的课题。在1989年获得了理学博士学位。