男，1947年 1月26日生于四川成都，北京市人，汉族。1978年恢复高等学校招生考试制度，9月从西藏考入北京大学历史系中国史专业修业四年。1982年7月毕业后留校任教至今。1988年于北京大学地理系获地理学硕士学位。现为北京大学历史学系教授、中国古代史专业博士生导师，教育部文科重点基地北京大学中国古代史研究中心副主任，北京大学中国历史地理与古地图研究中心主任。
李孝聪有较丰富的国外学术经历。除短期参加学术会议外，较长时间的出境访问有：1991年1月至1992年1月作为交换学者在荷兰莱顿大学汉学院研修；1992年1月至10月获英国学术院王宽诚奖学金在伦敦英国国家图书馆从事海外收藏中国古地图的调查与研究；1994年9月应意大利罗马大学文学院邀请，赴意大利、梵蒂冈调查那里收藏的中国古地图；1996年 9月，应邀赴荷兰莱顿大学汉学院进行《老北京城庙宇分布与民间社会》的合作研究；1998年～2005年多次应日本京都大学人文科学研究所邀请，调查研究京都、神户博物馆藏中国古地图；2000年3月至6月赴韩国高丽大学东洋史科执教；2002年应邀在美国国会图书馆做中国古地图的鉴定与研究，2004年10月至2005年1月再次应邀到美国国会图书馆做高级访问学者。
李孝聪的专业方向是中国历史地理学和中国古代地理文献。主要从事：区域与城市历史地理研究，中外比较城市史研究，历史文化名城的保护与规划，中国地图学史、古代地理图籍和中国地方志的教学与研究。