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高友鹤老师介绍
高友鹤 MD/PhD 1964
gaoyouhe@pumc.edu.cn,
2001,7- 中国协和医科大学 生理与病理生理学系 教授
1997,2-2001,7 博士后 讲师 哈佛医学院
1990,9-1997,2 理学博士，美国University of Connecticut
1982,9-1990,9 医学博士，中国协和医科大学
研究领域：
（A）人尿蛋白质组学及其应用；
（B）蛋白质组学实验方法的研究；
（C）蛋白质组学数据的质量控制；
（D）结点蛋白低丰度配体研究的新方法；
（E）蛋白质相互作用的生物信息学预测；
（F）细胞分泌蛋白质组。
● 全国优秀博士论文指导教师，中国生化分子生物学会蛋白质组学分会常务理事，杰出青年基金获得者，国务院学位委员会基础医学分委会委员。
● 本实验室注重激发学生对科学研究的兴趣，注重培育学生的主观能动性，注重培养学生自主选题，解决问题，分析结果的科学思维能力，注重培养独立的工作能力。学生均直接接受导师的辅导，具有独立的研究课题，同学之间互助合作。实验室具有科学、自主、平等、合作的研究氛围。毕业生具有英文文章的写作能力。
研究论文：
1. Lulu Jia, Ling Zhang, Chen Shao, Eli Song, Wei Sun, Mingxi Li, and Youhe Gao （2009）An attempt to understand kidney’s protein handling function by comparing plasma and urine proteomes Plos One 4（4）：e5146
2. Yong Chen, Bei Gu, Shuzhen Wu, Wei Sun, Sucan Ma, Yuqin Liu* and Youhe Gao* （2009）Using Enrichment Index for Quality Control of Secretory Protein Sample and Identification of Secretory ProteinsJournal of Mass Spectrometry 44（3）：397－403
3. Chen Shao, Wei Sun, Fuxin Li, Ruifeng Yang, Ling Zhang and Youhe Gao （2009）Oscore: a combined score to reduce false negative rate for peptide identification in tandem mass spectrometry analysisJournal of Mass Spectrometry 44(1):25-31
4. Wei Sun1, Yong Chen, Fuxin Li, Ling Zhang, Ruifeng Yang, Zhi Zhang, Dexian Zheng, Youhe Gao（2009）Dynamic urinary proteomic analysis reveals stable proteins to be potential biomarkersProteomics- clinical application 3（3）：370－382
5. 田瑞，马素参，杨涛，高友鹤（2009）通过筛选随机多肽文库研究Veli3 PDZ结构域配体结合特性基础医学与临床29（1）：14-18
6. Wei Sun, Ruifeng Yang, Ling Zhang, Chen Shao, Zhengguo Zhang* and Youhe Gao*（2009）Improve peptide identification by empirical peptide retention time database Rapid Communication in Mass Spectrometry 23（1）：109－118
7. Yan Wang; Yong Chen; Yang Zhang; Shuzhen Wu; Sucan Ma; Siqi Hu; Ling Zhang; Chen Shao; Mingxi Li and Youhe Gao (2008) Differential ConA-enriched Urinary Proteome in Rat Experimental Glomerular Diseases Biochemical and Biophysical Research Communications 4;371(3):385-90.
8. 张扬，张宏冰，杨先达，高友鹤（2008）利用文献讨论课提高研究生的科学素质基础医学与临床 28（8）：894－6
9. 李德岭, 高友鹤*, Patricia Mullan, Tricia Tang and Larry Gruppen* （2008）医学生选修双学位改善知识结构的意向调查中华医学教育杂志 28（4）：35－36， 68
10. Haiming Huang, Lei Li, Chenggang Wu, David Schibli, Karen Colwill, Sucan Ma, Chengjun Li, Protiva Roy, Krystina Ho, Zhou Songyang, Tony Pawson, Youhe Gao, and Shawn S.-C Li (2008) Defining the Specificity Space of the Human Src-homology 2 Domain Molecular & Cellular Proteomics 7(4):768-84.
11. MA SuCan**, SONG ELi**, GAO ShiJuan, TIAN Rui & GAO YouHe↑（2007）Rapid characterization of the binding property of HtrA2/Omi PDZ domain by validation screening of PDZ ligand library Sci China Ser C-Life Sci 50( 3) 412-422 （中文版马素参, 宋婀莉, 高诗娟, 田瑞, 高友鹤验证性筛选PDZ结构域结合配体文库快速研究HtrA2/Omi PDZ结构域的结合特性中国科学C辑:生命科学 2007 37 (1): 107-116）
12. Eli Song, Shijuan Gao, Rui Tian, Sucan Ma, Haiming Huang, Jiayan Guo, Yingna Li, Ling Zhang, and Youhe Gao（2006）A high-efficiency strategy for binding property characterization of peptide-binding domains. Molecular & Cellular Proteomics 5:1368-1381
13. Ling Zhang*, Chen Shao*, Dexian Zheng and Youhe Gao（2006）An integrated machine learning system to computationally screen protein databases for Protein binding peptide ligands with generalization capability Molecular & Cellular Proteomics 5: 1224-1232.
14. Wei Sun, Shijuan Gao, Linjie Wang, Yong Chen, Shuzhen Wu, Xiaorong Wang, Dexian Zheng, and Youhe Gao（2006）Microwave-assisted protein preparation and enzymatic digestion in proteomicsMolecular & Cellular Proteomics 5：769－776
15. Linjie Wang, Fuxin Li, Wei Sun, Shuzhen Wu, Xiaorong Wang, Ling Zhang, Dexian Zheng, Jue Wang and Youhe Gao（2006）Concanavalin A captured glycoproteins in healthy human urine Molecular & Cellular Proteomics 5: 560-562.
16. 田瑞，李英娜，宋婀莉，高诗娟，黄海明，张玲，马素参，高友鹤（2006）通过筛选随机多肽文库研究ZO1中PDZ1结构域的配体结合特点中国生物化学与分子生物学报 22（6）：484-90
17. Wei Sun, Shuzhen Wu, Xiaorong Wang, Fuxin Li, Jue Wang, Dexian Zheng, and Youhe Gao (2005) Human urine proteome analysis with three different separation approaches Proteomics 5（18）4994－5001
18. Wei Sun*, Shuzhen Wu, Xiaorong Wang, Dexian Zheng, Youhe Gao* (2005) An analysis of protein abundance suppression in proteomics research with five protein digestion mixtures. European Journal of Mass Spectrometry 11（6）575－580
19. Wei Sun, Fuxin Li and Youhe Gao. (2005) Evaluation of SEQUEST Result Filter—Xcorr and Unified Score. Chinese Medical Science Journal 20(2):99-103.
20. 马素参，黄海明，高友鹤（2005）充分利用烟草基因组DNA构建近随机多肽文库生物工程学报21(2):332-335
21. Haiming Huang and Youhe Gao (2005) A method for the generation of arbitrary peptide libraries. Molecular Biotechnology 30(2):135-142
22. Wei Sun*, Shuzhen Wu, Xiaorong Wang, Dexian Zheng, and Youhe Gao* (2004) A Systematical Analysis of Tryptic Peptide Identification with Reverse Phase Liquid Chromatography and Electrospray Ion Trap Mass Spectrometry. Genomics Proteomics and Bioinformatics 2(3):174-183
23. Wei Sun, Fuxin Li, Jue Wang, Dexian Zheng and Youhe Gao (2004) AMASS: Software for automatically validating the quality of MS/MS spectrum from SEQUEST results. Molecular & Cellular Proteomics, 3: 1194 - 1199.
Automatic validation of MS/MS spectra. TOOLbox Journal of Proteome Research 4(1):18
24. Haiming Huang, Yuchen Jiao, Rui Xu, and Youhe Gao* (2004) Construction of A Non-Redundant Human SH2 Domain Database Genomics Proteomics and Bioinformatics 2(2): 119-122
25. Fuxin Li 1*, Wei Sun 2, Youhe Gao 2* Jue Wang1 （2004）RScore: A Peptide Randomicity Score For Evaluating MS/MS Spectra. Rapid Communication in Mass Spectrometry 18(14): 1655-9
26. Haiming Huang, Ling Zhang, Sucan Ma, and Youhe Gao* （2004）Finding Potential Ligands for PDZ Domains by Tailfit. Chinese Medical Sciences Journal 19(2):97-104
27. 郭佳岩，宋婀莉，黄海明，马素参，高友鹤（2004）利用随机多肽文库研究ZO－1中PDZ3结构域的结合配体特点中国生物化学与分子生物学报 20（3）341－346。
28. 郭佳岩,宋婀莉,马素参,高友鹤（2004）快速LacZ检测法提高酵母双杂交试验的敏感度生物技术 14(1):31-33
29. 黄海明，马素参，彭隽敏，俞强，任瑞宝，高友鹤（2003）快速构建蛋白质结构域克隆库的方法中国生物化学与分子生物学报 19（4）:537-541
信息交流：
30.高诗娟，宋婀莉，田瑞，高友鹤 (2005) 酵母双杂交常用菌株AH109半乳糖苷酶检测实验呈阳性中国生物化学与分子生物学报 21(1):71
综述文章：
31. 陈勇，高友鹤化学交联技术在蛋白质相互作用研究中的应用（2008）生命的化学 28：（4）484－8
32. 宋婀莉，高友鹤（2007）PICK1：一个功能多样的药靶蛋白中国生物化学与分子生物学报（Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology,） 23 (9) :697～705
33. 王林杰，郑德先，高友鹤（2007）糖蛋白质组研究进展基础医学与临床27（2）：122 -128
34. 田瑞，高诗娟，宋婀莉，郑德先，高友鹤（2007）相互作用结构域SH3和WW的蛋白质组学研究基础医学与临床27（2）：129－133
35. 高诗娟，高友鹤（2005）SH2结构域识别磷酸化酪氨酸的分子机制及其生物学作用医学分子生物学杂志 2（6）：427－429
36. 王林杰，高友鹤 (2005) 复杂性状疾病的系统生物学研究基础医学与临床 25(1):11-15
37. 孙伟，高友鹤（2003）蛋白质组学研究进展生理通讯 22（3）86－91
38. 郭佳岩，高友鹤，崔莲仙（2003）蛋白质组学技术在人体简单系统蛋白质全谱检测的应用基础医学与临床23(2):136-140
39. 李英娜，高友鹤，崔莲仙（2003）结构域蛋白质组学研究进展基础医学与临床 23(2):132-135
论著：
<人体病理生理学> 第三版 2008 人民卫生出版社，北京市，第二篇、第五章 P38－51
蛋白质相互作用与疾病
宋婀莉 高友鹤
研究生获奖情况：
1、孙伟Molecular & Cellular Proteomics主办的2005年第七届国际健康与生命科学中的质谱（Seventh International Symposium on Mass Spectrometry in the Health and Life Sciences）会议旅行奖；2005年在法国里昂召开的世界生命科学论坛奖学金（BioVision.Nxt 2005 Fellowship of The World Life Sciences Forum BioVision, 2005, Lyon, France）
2、劭晨 美国生物化学分子生物学学会（ASBMB）2006年度年会的旅行奖。
3、王林杰 美国生物化学分子生物学学会（ASBMB）2006年度年会的旅行奖。
4、张玲 国际生物化学与分子生物学联盟（IUBMB）2006年度年会的旅行奖。
5、陈勇 美国生物化学分子生物学学会（ASBMB）2007年度年会的旅行奖。
6、张玲 美国生物化学分子生物学学会（ASBMB）2007年度年会的旅行奖。
7、田瑞 美国生物化学分子生物学学会（ASBMB）2007年度年会的旅行奖。
8、贾露露 美国生物化学分子生物学学会（ASBMB）2007年度年会的旅行奖。
9、孙伟 基础医学二○○七年全国优秀博士学位论文液质联用蛋白质组学鉴定方法的建立及其在正常人尿蛋白质组鉴定中的应用清华大学 北京协和医学院-清华大学医学部
10、王燕 美国应用生物系统公司－蛋白质组学优秀青年学者旅行奖 2008 Joint Symposium of the 4th Asian and Oceania Human Proteome Organization (AOHUPO) and the 2nd Pacific-Rim International Conference on Protein Science (PRICPS) 澳大利亚 Cairns。
11、张扬 美国生物化学分子生物学学会（ASBMB）2009年度年会的旅行奖。
12、胡斯奇 美国生物化学分子生物学学会（ASBMB）2009年度年会的旅行奖
gaoyouhe@pumc.edu.cn,
2001,7- 中国协和医科大学 生理与病理生理学系 教授
1997,2-2001,7 博士后 讲师 哈佛医学院
1990,9-1997,2 理学博士，美国University of Connecticut
1982,9-1990,9 医学博士，中国协和医科大学
研究领域：
（A）人尿蛋白质组学及其应用；
（B）蛋白质组学实验方法的研究；
（C）蛋白质组学数据的质量控制；
（D）结点蛋白低丰度配体研究的新方法；
（E）蛋白质相互作用的生物信息学预测；
（F）细胞分泌蛋白质组。
● 全国优秀博士论文指导教师，中国生化分子生物学会蛋白质组学分会常务理事，杰出青年基金获得者，国务院学位委员会基础医学分委会委员。
● 本实验室注重激发学生对科学研究的兴趣，注重培育学生的主观能动性，注重培养学生自主选题，解决问题，分析结果的科学思维能力，注重培养独立的工作能力。学生均直接接受导师的辅导，具有独立的研究课题，同学之间互助合作。实验室具有科学、自主、平等、合作的研究氛围。毕业生具有英文文章的写作能力。
研究论文：
1. Lulu Jia, Ling Zhang, Chen Shao, Eli Song, Wei Sun, Mingxi Li, and Youhe Gao （2009）An attempt to understand kidney’s protein handling function by comparing plasma and urine proteomes Plos One 4（4）：e5146
2. Yong Chen, Bei Gu, Shuzhen Wu, Wei Sun, Sucan Ma, Yuqin Liu* and Youhe Gao* （2009）Using Enrichment Index for Quality Control of Secretory Protein Sample and Identification of Secretory ProteinsJournal of Mass Spectrometry 44（3）：397－403
3. Chen Shao, Wei Sun, Fuxin Li, Ruifeng Yang, Ling Zhang and Youhe Gao （2009）Oscore: a combined score to reduce false negative rate for peptide identification in tandem mass spectrometry analysisJournal of Mass Spectrometry 44(1):25-31
4. Wei Sun1, Yong Chen, Fuxin Li, Ling Zhang, Ruifeng Yang, Zhi Zhang, Dexian Zheng, Youhe Gao（2009）Dynamic urinary proteomic analysis reveals stable proteins to be potential biomarkersProteomics- clinical application 3（3）：370－382
5. 田瑞，马素参，杨涛，高友鹤（2009）通过筛选随机多肽文库研究Veli3 PDZ结构域配体结合特性基础医学与临床29（1）：14-18
6. Wei Sun, Ruifeng Yang, Ling Zhang, Chen Shao, Zhengguo Zhang* and Youhe Gao*（2009）Improve peptide identification by empirical peptide retention time database Rapid Communication in Mass Spectrometry 23（1）：109－118
7. Yan Wang; Yong Chen; Yang Zhang; Shuzhen Wu; Sucan Ma; Siqi Hu; Ling Zhang; Chen Shao; Mingxi Li and Youhe Gao (2008) Differential ConA-enriched Urinary Proteome in Rat Experimental Glomerular Diseases Biochemical and Biophysical Research Communications 4;371(3):385-90.
8. 张扬，张宏冰，杨先达，高友鹤（2008）利用文献讨论课提高研究生的科学素质基础医学与临床 28（8）：894－6
9. 李德岭, 高友鹤*, Patricia Mullan, Tricia Tang and Larry Gruppen* （2008）医学生选修双学位改善知识结构的意向调查中华医学教育杂志 28（4）：35－36， 68
10. Haiming Huang, Lei Li, Chenggang Wu, David Schibli, Karen Colwill, Sucan Ma, Chengjun Li, Protiva Roy, Krystina Ho, Zhou Songyang, Tony Pawson, Youhe Gao, and Shawn S.-C Li (2008) Defining the Specificity Space of the Human Src-homology 2 Domain Molecular & Cellular Proteomics 7(4):768-84.
11. MA SuCan**, SONG ELi**, GAO ShiJuan, TIAN Rui & GAO YouHe↑（2007）Rapid characterization of the binding property of HtrA2/Omi PDZ domain by validation screening of PDZ ligand library Sci China Ser C-Life Sci 50( 3) 412-422 （中文版马素参, 宋婀莉, 高诗娟, 田瑞, 高友鹤验证性筛选PDZ结构域结合配体文库快速研究HtrA2/Omi PDZ结构域的结合特性中国科学C辑:生命科学 2007 37 (1): 107-116）
12. Eli Song, Shijuan Gao, Rui Tian, Sucan Ma, Haiming Huang, Jiayan Guo, Yingna Li, Ling Zhang, and Youhe Gao（2006）A high-efficiency strategy for binding property characterization of peptide-binding domains. Molecular & Cellular Proteomics 5:1368-1381
13. Ling Zhang*, Chen Shao*, Dexian Zheng and Youhe Gao（2006）An integrated machine learning system to computationally screen protein databases for Protein binding peptide ligands with generalization capability Molecular & Cellular Proteomics 5: 1224-1232.
14. Wei Sun, Shijuan Gao, Linjie Wang, Yong Chen, Shuzhen Wu, Xiaorong Wang, Dexian Zheng, and Youhe Gao（2006）Microwave-assisted protein preparation and enzymatic digestion in proteomicsMolecular & Cellular Proteomics 5：769－776
15. Linjie Wang, Fuxin Li, Wei Sun, Shuzhen Wu, Xiaorong Wang, Ling Zhang, Dexian Zheng, Jue Wang and Youhe Gao（2006）Concanavalin A captured glycoproteins in healthy human urine Molecular & Cellular Proteomics 5: 560-562.
16. 田瑞，李英娜，宋婀莉，高诗娟，黄海明，张玲，马素参，高友鹤（2006）通过筛选随机多肽文库研究ZO1中PDZ1结构域的配体结合特点中国生物化学与分子生物学报 22（6）：484-90
17. Wei Sun, Shuzhen Wu, Xiaorong Wang, Fuxin Li, Jue Wang, Dexian Zheng, and Youhe Gao (2005) Human urine proteome analysis with three different separation approaches Proteomics 5（18）4994－5001
18. Wei Sun*, Shuzhen Wu, Xiaorong Wang, Dexian Zheng, Youhe Gao* (2005) An analysis of protein abundance suppression in proteomics research with five protein digestion mixtures. European Journal of Mass Spectrometry 11（6）575－580
19. Wei Sun, Fuxin Li and Youhe Gao. (2005) Evaluation of SEQUEST Result Filter—Xcorr and Unified Score. Chinese Medical Science Journal 20(2):99-103.
20. 马素参，黄海明，高友鹤（2005）充分利用烟草基因组DNA构建近随机多肽文库生物工程学报21(2):332-335
21. Haiming Huang and Youhe Gao (2005) A method for the generation of arbitrary peptide libraries. Molecular Biotechnology 30(2):135-142
22. Wei Sun*, Shuzhen Wu, Xiaorong Wang, Dexian Zheng, and Youhe Gao* (2004) A Systematical Analysis of Tryptic Peptide Identification with Reverse Phase Liquid Chromatography and Electrospray Ion Trap Mass Spectrometry. Genomics Proteomics and Bioinformatics 2(3):174-183
23. Wei Sun, Fuxin Li, Jue Wang, Dexian Zheng and Youhe Gao (2004) AMASS: Software for automatically validating the quality of MS/MS spectrum from SEQUEST results. Molecular & Cellular Proteomics, 3: 1194 - 1199.
Automatic validation of MS/MS spectra. TOOLbox Journal of Proteome Research 4(1):18
24. Haiming Huang, Yuchen Jiao, Rui Xu, and Youhe Gao* (2004) Construction of A Non-Redundant Human SH2 Domain Database Genomics Proteomics and Bioinformatics 2(2): 119-122
25. Fuxin Li 1*, Wei Sun 2, Youhe Gao 2* Jue Wang1 （2004）RScore: A Peptide Randomicity Score For Evaluating MS/MS Spectra. Rapid Communication in Mass Spectrometry 18(14): 1655-9
26. Haiming Huang, Ling Zhang, Sucan Ma, and Youhe Gao* （2004）Finding Potential Ligands for PDZ Domains by Tailfit. Chinese Medical Sciences Journal 19(2):97-104
27. 郭佳岩，宋婀莉，黄海明，马素参，高友鹤（2004）利用随机多肽文库研究ZO－1中PDZ3结构域的结合配体特点中国生物化学与分子生物学报 20（3）341－346。
28. 郭佳岩,宋婀莉,马素参,高友鹤（2004）快速LacZ检测法提高酵母双杂交试验的敏感度生物技术 14(1):31-33
29. 黄海明，马素参，彭隽敏，俞强，任瑞宝，高友鹤（2003）快速构建蛋白质结构域克隆库的方法中国生物化学与分子生物学报 19（4）:537-541
信息交流：
30.高诗娟，宋婀莉，田瑞，高友鹤 (2005) 酵母双杂交常用菌株AH109半乳糖苷酶检测实验呈阳性中国生物化学与分子生物学报 21(1):71
综述文章：
31. 陈勇，高友鹤化学交联技术在蛋白质相互作用研究中的应用（2008）生命的化学 28：（4）484－8
32. 宋婀莉，高友鹤（2007）PICK1：一个功能多样的药靶蛋白中国生物化学与分子生物学报（Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology,） 23 (9) :697～705
33. 王林杰，郑德先，高友鹤（2007）糖蛋白质组研究进展基础医学与临床27（2）：122 -128
34. 田瑞，高诗娟，宋婀莉，郑德先，高友鹤（2007）相互作用结构域SH3和WW的蛋白质组学研究基础医学与临床27（2）：129－133
35. 高诗娟，高友鹤（2005）SH2结构域识别磷酸化酪氨酸的分子机制及其生物学作用医学分子生物学杂志 2（6）：427－429
36. 王林杰，高友鹤 (2005) 复杂性状疾病的系统生物学研究基础医学与临床 25(1):11-15
37. 孙伟，高友鹤（2003）蛋白质组学研究进展生理通讯 22（3）86－91
38. 郭佳岩，高友鹤，崔莲仙（2003）蛋白质组学技术在人体简单系统蛋白质全谱检测的应用基础医学与临床23(2):136-140
39. 李英娜，高友鹤，崔莲仙（2003）结构域蛋白质组学研究进展基础医学与临床 23(2):132-135
论著：
<人体病理生理学> 第三版 2008 人民卫生出版社，北京市，第二篇、第五章 P38－51
蛋白质相互作用与疾病
宋婀莉 高友鹤
研究生获奖情况：
1、孙伟Molecular & Cellular Proteomics主办的2005年第七届国际健康与生命科学中的质谱（Seventh International Symposium on Mass Spectrometry in the Health and Life Sciences）会议旅行奖；2005年在法国里昂召开的世界生命科学论坛奖学金（BioVision.Nxt 2005 Fellowship of The World Life Sciences Forum BioVision, 2005, Lyon, France）
2、劭晨 美国生物化学分子生物学学会（ASBMB）2006年度年会的旅行奖。
3、王林杰 美国生物化学分子生物学学会（ASBMB）2006年度年会的旅行奖。
4、张玲 国际生物化学与分子生物学联盟（IUBMB）2006年度年会的旅行奖。
5、陈勇 美国生物化学分子生物学学会（ASBMB）2007年度年会的旅行奖。
6、张玲 美国生物化学分子生物学学会（ASBMB）2007年度年会的旅行奖。
7、田瑞 美国生物化学分子生物学学会（ASBMB）2007年度年会的旅行奖。
8、贾露露 美国生物化学分子生物学学会（ASBMB）2007年度年会的旅行奖。
9、孙伟 基础医学二○○七年全国优秀博士学位论文液质联用蛋白质组学鉴定方法的建立及其在正常人尿蛋白质组鉴定中的应用清华大学 北京协和医学院-清华大学医学部
10、王燕 美国应用生物系统公司－蛋白质组学优秀青年学者旅行奖 2008 Joint Symposium of the 4th Asian and Oceania Human Proteome Organization (AOHUPO) and the 2nd Pacific-Rim International Conference on Protein Science (PRICPS) 澳大利亚 Cairns。
11、张扬 美国生物化学分子生物学学会（ASBMB）2009年度年会的旅行奖。
12、胡斯奇 美国生物化学分子生物学学会（ASBMB）2009年度年会的旅行奖
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