所长：彭其渊教授博士生导师
主要研究方向：
交通运输规划与系统优化
交通运输信息技术
客运专线运输组织
现有线列车提速的理论与方法
运输组织优化理论与方法
集装箱运输组织
智能运输系统
行车指挥自动化
物流系统优化与物流信息技术
综合运输系统优化
主要研究成果：
多年来，交通运输与自动化研究所在计算机编制列车运行图、列车运行调度指挥关键技术、铁路客货列车提速、客运专线运输组织、集装箱运输组织、智能运输系统、交通运输信息技术和物流系统规划等方面完成了国家863计划项目、国家自然科学基金项目以及省部级等科研项目并获得了铁道部科技进步一等奖、山东省科技进步三等奖以及北京铁路局、济南铁路局等单位的奖项多项。在国内外学术刊物发表学术论文近百篇、出版专著三部。