主要从事以基因组学为基础的作物遗传改良研究，目前主要研究内容分为以下几个方面：一是利用功能基因组学、生物信息学等方法相结合进行棉花重要农艺性状基因定位、作图、克隆与功能分析等研究，力图阐明产量、品质、抗性等重要、复杂农艺性状的遗传及分子基础；二是利用分子标记辅助育种的方法进行棉花优质、高产、抗病等重要性状的遗传改良与种质创新；三是棉花重要品质性状的发育生理和生化机理研究。主持中国博士后基金、山东省科技厅良种产业化项目、山东农业大学博士基金、农业部等多项课题，作为主要研究人员承担国家948、国家科技攻关、国家自然科学基金项目多项。在《Genome》、《Journal of Integrative Plant Biology》、《Theoretical & Applied Genetics》、《Molecular Genetics and Genomics》、《Genetics》《中国农业科学》等著名学术刊物发表论文20多篇，有6篇被SCI收录。